Bioinformatiker: Gør en forskel i den patientnære kræftbehandling på OUH
Bioinformatiker til Afdeling for Klinisk Patologi, OUH
Vil du være en del af en afdeling i rivende udvikling inden for præcisionsdiagnostik og personlig medicin?
Afdeling for Klinisk Patologi, OUH, søger en engageret bioinformatiker til en spændende stilling pr. 1. september 2024 eller efter aftale.
Hvad tilbyder vi dig?
Hos os får du en unik mulighed for at arbejde i frontlinjen af molekylære analyser indenfor kræftområdet. Du bliver en del af et innovativt miljø med kontinuerlig udvikling, og får ansvar for avancerede opgaver, der direkte påvirker patienternes behandling og livskvalitet. Du vil arbejde i et patientnært miljø, med veletableret tværfagligt samarbejde med bioinformatikere, molekylærbiologer, bioanalytikere og læger (patologer/klinikere, oftest onkologer). Du vil have stor indflydelse og medbestemmelse i arbejdsplanlægningen, samt få en arbejdsdag med fokus på gode kollegiale relationer, teamwork og høj kvalitet i alle aktiviteter.
Som bioinformatiker hos os, kommer du til at:
- Have en nøglefunktion i hjemtagning af helgenomsekventering
- Vedligeholde og udvikle bioinformatiske pipelines til komplekse NGS data fra helgenom/store NGS paneler
- Udvikle/optimere på nuværende bioinformatiske løsninger for NGS paneler
- Udvikle automatiseret løsninger til håndtering af NGS data, fortolkning og svarafgivelse
- Udbygge samarbejdet med bioinformatikere på andre kliniske afdelinger
- Sikre ’data storage’ af patientdata genereret fra NGS analyser
Derudover vil du kunne:
- Fagligt supportere speciallæger angående kliniske problemstillinger, som med fordel kan understøtte integreret diagnostik samt valg af præcisionsmedicin
- Kontinuerlig udbygge din faglige udvikling inden for præcisionsmedicin og integreret diagnostik, bl.a. ved selvstændigt at deltage i arbejdsgrupper og nationale/internationale konferencer, fx biomarkør- og ”classifier” algoritmer
- Deltage i implementering af nye analyser samt udviklings- og forskningsopgaver
- Få mulighed for at deltage i fortolkning og besvarelse af molekylære analyser
Om dig
Vi søger en erfaren og løsningsorienteret bioinformatiker med en relevant kandidatgrad, som har arbejdet med data processering af rådata fra NGS analyser. Du arbejder proaktivt, og finder motivation i at arbejde med patientnære problemstillinger, og værdsætter et tværfagligt samarbejde.
Derudover ser vi gerne at du har:
- Erfaring med Linux-baseret platforme, HPC miljøer og bioinformatiske tools (fx ASCAT, Strelka)
- Erfaring med analysesoftware til molekylærgenetiske data, herunder Next Generation Sequencing data, bl.a. til visualisering af data output
- Kendskab til Bash, Python, R eller lign.
- Kendskab til workflow managers, som Nextflow eller Snakemake
Arbejdssted:
Afdeling for Klinisk Patologi er en tværgående, paraklinisk afdeling, der yder patoanatomisk diagnostik for Odense Universitetshospital, privathospitaler, almen praksis, speciallægepraksis og tandlægepraksis på Fyn. Endvidere udføres højt specialiserede undersøgelser for såvel Region Syddanmark som for øvrige regioner i landet. Afdelingen arbejder på at blive akkrediteret i 2024.
Som ny kollega, blandt 8 molekylærbiologer, vil du medvirke til, at afdelingen fastholder og udbygger sin position som en af landets førende afdelinger, med avanceret metoder til molekylære analyser indenfor diagnostik, prognosticering og prædiktion af behandlingsrespons. Organisatorisk er molekylærpatologien tilknyttet afdelingens driftssøjle og al diagnostisk virksomhed udøves under overordnet ansvar af cheflægen.
Løn- og ansættelsesforhold:
Løn- og ansættelsesforhold sker i henhold til overenskomst mellem regionernes Lønnings- og takstnævn og
Dansk Magisterforening eller anden forhandlingsberettiget organisation.
Yderligere oplysninger:
Du er velkommen til at kontakte ledende molekylærbiolog Maria Lyng, tlf. 6541 3431, eller cheflæge Tina Green, tlf. 6541 4891.
Ansøgningsfrist:
04.08.2024
Samtaler forventes afholdt i uge 33/34.